MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 111444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009633	AGG	2	6	180666	180671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_009633	AAT	2	6	180673	180678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_009633	TGA	2	6	180711	180716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388009
4004	NC_009633	GAGAAG	2	12	180800	180811	50 %	0 %	50 %	0 %	150388009
4005	NC_009633	AAG	2	6	180820	180825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388009
4006	NC_009633	ACAG	2	8	180910	180917	50 %	0 %	25 %	25 %	150388009
4007	NC_009633	TGT	2	6	180924	180929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388009
4008	NC_009633	TGG	2	6	180939	180944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388009
4009	NC_009633	A	6	6	180965	180970	100 %	0 %	0 %	0 %	150388009
4010	NC_009633	TAAA	2	8	181022	181029	75 %	25 %	0 %	0 %	150388009
4011	NC_009633	GAA	2	6	181066	181071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388009
4012	NC_009633	CAG	3	9	181196	181204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388009
4013	NC_009633	CCTT	2	8	181205	181212	0 %	50 %	0 %	50 %	150388009
4014	NC_009633	AAT	2	6	181229	181234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388009
4015	NC_009633	TTTTA	2	10	181270	181279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009633	AAC	2	6	181296	181301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009633	AGG	2	6	181447	181452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009633	A	6	6	181465	181470	100 %	0 %	0 %	0 %	150388010
4019	NC_009633	ATTT	2	8	181491	181498	25 %	75 %	0 %	0 %	150388010
4020	NC_009633	CTTT	2	8	181535	181542	0 %	75 %	0 %	25 %	150388010
4021	NC_009633	ATT	3	9	181558	181566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
4022	NC_009633	TAT	2	6	181585	181590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
4023	NC_009633	CTA	2	6	181615	181620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388010
4024	NC_009633	A	6	6	181673	181678	100 %	0 %	0 %	0 %	150388010
4025	NC_009633	AGG	2	6	181695	181700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150388010
4026	NC_009633	TCTAT	2	10	181729	181738	20 %	60 %	0 %	20 %	150388010
4027	NC_009633	GTA	2	6	181801	181806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
4028	NC_009633	T	6	6	181855	181860	0 %	100 %	0 %	0 %	150388010
4029	NC_009633	TGC	2	6	182007	182012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388010
4030	NC_009633	TA	3	6	182073	182078	50 %	50 %	0 %	0 %	150388010
4031	NC_009633	A	6	6	182089	182094	100 %	0 %	0 %	0 %	150388010
4032	NC_009633	CAA	2	6	182141	182146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388010
4033	NC_009633	GCA	2	6	182314	182319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388010
4034	NC_009633	GT	3	6	182444	182449	0 %	50 %	50 %	0 %	150388010
4035	NC_009633	CAT	2	6	182451	182456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388010
4036	NC_009633	CAG	2	6	182468	182473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388010
4037	NC_009633	TAT	2	6	182513	182518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
4038	NC_009633	AGCC	2	8	182528	182535	25 %	0 %	25 %	50 %	150388010
4039	NC_009633	TTC	2	6	182554	182559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150388010
4040	NC_009633	TAT	2	6	182573	182578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
4041	NC_009633	TGA	2	6	182651	182656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
4042	NC_009633	AGC	2	6	182724	182729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388010
4043	NC_009633	TGG	2	6	182741	182746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388010
4044	NC_009633	GGC	2	6	182757	182762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	150388010
4045	NC_009633	TTAT	2	8	182945	182952	25 %	75 %	0 %	0 %	150388010
4046	NC_009633	GAT	2	6	182989	182994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
4047	NC_009633	TTA	2	6	183001	183006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388010
4048	NC_009633	GAA	2	6	183036	183041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388010
4049	NC_009633	TGA	2	6	183050	183055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388010
4050	NC_009633	GTT	2	6	183191	183196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150388011
4051	NC_009633	GAA	2	6	183248	183253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
4052	NC_009633	ATG	2	6	183305	183310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
4053	NC_009633	CAA	2	6	183371	183376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388011
4054	NC_009633	TTAA	2	8	183377	183384	50 %	50 %	0 %	0 %	150388011
4055	NC_009633	A	6	6	183383	183388	100 %	0 %	0 %	0 %	150388011
4056	NC_009633	TGA	2	6	183391	183396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
4057	NC_009633	TGGA	2	8	183474	183481	25 %	25 %	50 %	0 %	150388011
4058	NC_009633	TGG	2	6	183489	183494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388011
4059	NC_009633	AGA	2	6	183508	183513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
4060	NC_009633	ATC	2	6	183542	183547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388011
4061	NC_009633	TAT	2	6	183602	183607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388011
4062	NC_009633	GAT	2	6	183608	183613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
4063	NC_009633	ATTC	2	8	183727	183734	25 %	50 %	0 %	25 %	150388011
4064	NC_009633	A	8	8	183753	183760	100 %	0 %	0 %	0 %	150388011
4065	NC_009633	AAT	2	6	183773	183778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388011
4066	NC_009633	GAA	2	6	183869	183874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
4067	NC_009633	TGA	2	6	183898	183903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
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4069	NC_009633	GA	3	6	183980	183985	50 %	0 %	50 %	0 %	150388011
4070	NC_009633	AAGA	2	8	184112	184119	75 %	0 %	25 %	0 %	150388011
4071	NC_009633	TCAA	2	8	184144	184151	50 %	25 %	0 %	25 %	150388011
4072	NC_009633	TGA	2	6	184182	184187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388011
4073	NC_009633	CAAG	2	8	184213	184220	50 %	0 %	25 %	25 %	150388011
4074	NC_009633	AAG	2	6	184323	184328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388011
4075	NC_009633	TAC	2	6	184362	184367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150388011
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4079	NC_009633	A	8	8	184520	184527	100 %	0 %	0 %	0 %	150388011
4080	NC_009633	AAT	2	6	184530	184535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388011
4081	NC_009633	A	6	6	184550	184555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009633	AGA	2	6	184558	184563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_009633	A	6	6	184572	184577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_009633	A	6	6	184593	184598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_009633	AGG	2	6	184631	184636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_009633	AT	3	6	184639	184644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_009633	A	6	6	184680	184685	100 %	0 %	0 %	0 %	150388012
4088	NC_009633	AAG	2	6	184697	184702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388012
4089	NC_009633	AGA	2	6	184741	184746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388012
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4091	NC_009633	AGAA	2	8	184804	184811	75 %	0 %	25 %	0 %	150388012
4092	NC_009633	A	6	6	184908	184913	100 %	0 %	0 %	0 %	150388012
4093	NC_009633	TAA	2	6	184922	184927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150388012
4094	NC_009633	T	6	6	184949	184954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_009633	AAAT	2	8	184967	184974	75 %	25 %	0 %	0 %	150388013
4096	NC_009633	ATT	2	6	185006	185011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150388013
4097	NC_009633	GAA	2	6	185016	185021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388013
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4099	NC_009633	GAGAT	2	10	185103	185112	40 %	20 %	40 %	0 %	150388013
4100	NC_009633	TA	3	6	185288	185293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_009633	G	7	7	185306	185312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_009633	TGG	2	6	185318	185323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388014
4103	NC_009633	A	6	6	185348	185353	100 %	0 %	0 %	0 %	150388014
4104	NC_009633	GAAAT	2	10	185371	185380	60 %	20 %	20 %	0 %	150388014
4105	NC_009633	CCA	2	6	185390	185395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388014
4106	NC_009633	AAG	2	6	185396	185401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388014
4107	NC_009633	CCA	2	6	185429	185434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150388014
4108	NC_009633	AAG	2	6	185435	185440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150388014
4109	NC_009633	GCA	2	6	185445	185450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150388014
4110	NC_009633	GATG	2	8	185496	185503	25 %	25 %	50 %	0 %	150388014
4111	NC_009633	ATG	2	6	185522	185527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388014
4112	NC_009633	AAGCA	2	10	185533	185542	60 %	0 %	20 %	20 %	150388014
4113	NC_009633	TAGA	2	8	185573	185580	50 %	25 %	25 %	0 %	150388014
4114	NC_009633	GTG	2	6	185620	185625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150388014
4115	NC_009633	ATG	2	6	185637	185642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150388014
4116	NC_009633	ATTG	2	8	185678	185685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_009633	ATTTA	2	10	185705	185714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_009633	TA	3	6	185718	185723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_009633	TAAA	2	8	185753	185760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_009633	CAA	2	6	185767	185772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_009633	AGG	2	6	185784	185789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_009633	ATTG	2	8	185840	185847	25 %	50 %	25 %	0 %	150388015
4123	NC_009633	GCT	2	6	185868	185873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150388015
4124	NC_009633	AAC	2	6	185920	185925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150388015
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4126	NC_009633	GA	3	6	185998	186003	50 %	0 %	50 %	0 %	150388015
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